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La estructura organizacional de la Dirección General Marítima - Centro de Investigaciones Oceanográficas e Hidrográficas del Pacífico (Dimar-CCCP) se modificó con el Decreto 5057 del 30 de diciembre de 2009 del Ministerio de Defensa Nacional, estableciendo las Áreas que se describen a continuación, así como la Unidad de apoyo administrativo ubicada físicamente en la ciudad de Buenaventura.

Estructura interna de la Dimar-CCCP.

Buque Oceanográfico
•    5KLA ARC Gorgona

Dirección CCCP
•   Director
•    Digitador - Auxiliar Administrativo
•   Evaluación y control
•    Personal, capacitación y salud ocupacional

Área Manejo Integrado de Zona Costera
•   Investigador (Responsable de Área)
•   Investigador Riesgos Marinos
•   Investigador Procesos Costeros
•   Auxiliar de Campo

Área Oceanografía Operacional
•   Investigador (Responsable de Área)
•   Digitador – Auxiliar Administrativo
•   Investigador Interacción Océano Atmósfera
•   Investigador Oceanografía Dinámica
•   Técnico Oceanografía
•   Investigador Pronósticos Meteomarinos
•   Técnico Pronósticos Meteomarinos

Área Protección Medio Marino
•   Investigador (Responsable de Área)
•   Investigadores

Área Técnica
•   Responsable de Área
•   Digitador – Auxiliar Administrativo
•   Ingeniero SIG
•   Digitalizador SIG
•   Ingeniero Sensores Remotos
•   Técnico Sensores Remotos
•   Profesional Laboratorio de Química
•   Profesional Laboratorio de Biología
•   Técnico Laboratorio
•   Ingeniero Software, Bases de Datos y Redes
•   Técnico Hardware y Software
•   Profesional Divulgación Científica

Área de Apoyo
•   Seguridad industrial y física (Servicios generales, transporte, módulo habitacional y patrón de lanchas)

Unidad Administrativa
•   Área Financiera (Presupuesto y pagaduría)
•   Área Abastecimientos (Adquisiciones, contratos, almacén, activos fijos y bienes inmuebles)

Estructura interna de la Intendencia Regional No.1 (Inred1).