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De acuerdo con lo estipulado en el artículo 6 del Decreto 5057 de 2009 del Ministerio de Defensa de Colombia, son funciones del Centro de Investigaciones Oceanográficas e Hidrográficas del Pacífico (CCCP), dentro de la jurisdicción:

• Estudiar y ejecutar proyectos de investigación y evaluación de fenómenos oceanográficos, hidrográficos y de contaminación marina, de acuerdo con los programas de la Dirección General Marítima.

• Ejecutar y evaluar los proyectos de investigación que sean aprobados por la Dirección.

• Dar a conocer, según la clasificación de seguridad correspondiente, los resultados de proyectos ejecutados, a través del Sistema de Información Geográfica.

• Prestar colaboración docente a la Escuela Naval de Oficiales "Almirante Padilla" en la materia de Oceanografía e Hidrografía.

• Suministrar servicios técnico-marinos de apoyo, datos oceanográficos e hidrográficos, análisis físicos, químicos y biológicos, metrología de equipos y elementos de laboratorio para la investigación y otras actividades marítimas.

• Elaborar proyectos de investigación y productos que apoyen las funciones de la Fuerza Pública.

• Apoyar a las Capitanías de Puerto en la elaboración de estudios técnicos de jurisdicción cuando les sea solicitado.

• Colaborar y participar conjuntamente con organismos nacionales o extranjeros en proyectos y/o estudios de Investigación y Desarrollo de interés Nacional en las áreas científicas de su competencia.

• Contribuir a los programas generales de preservación y conservación del medio marino.

• Controlar, vigilar y administrar los sistemas de medición de parámetros oceanográficos, meteorológicos de la Entidad en su respectiva jurisdicción.

• Suministrar asesoría técnica y científica tanto a la Dirección General Marítima, así como los servicios prestados a las demás entidades públicas o privadas que lo requieran.

• Las demás funciones que le sean asignadas y que correspondan a la naturaleza de la dependencia.